Ti žádají, aby se zonace tvořila vědeckými metodami z map výskytu chráněných biotopů a organizmů, ne na základě pohledu lokálních politiků. Podle ekologů se návrhy spíš zaměřují na rozvoj podnikatelských aktivit a nechrání přírodu. Kraj například ustoupil od kritizovaného návrhu obecně prospěšné společnosti, čtyřstupňovou zonaci mění na třístupňovou a řeší i cesty, které by měl zaručovat zákon. Radní Plzeňského kraje Václav Štekl (KSČM) tvrdí, že návrh úplně ustoupil od definování zonace v počtech procent rozlohy parku, pouze prý přesně specifikuje, jaké území by v jaké zóně mělo být. Ponechává to na následné vyhlášce ministerstva, které pak může jednat s vědci. Podle Štekla se nynější podoba plzeňského návrhu normy shoduje s ministerskou v několika bodech.
Oba návrhy se tak budou zřejmě souběžně projednávat ve výboru pro životní prostředí a zemědělském výboru, jehož se zákon týká vzhledem k hospodaření v lesích a rozvoji venkova. "Možná by se z toho (obou návrhů zákona) dal vyrobit nějaký smysluplný kompromis a řešit, který ze zákonů se vezme jako základ pro další projednávání," uvedl Papež. Plzeňský kraj už nemá možnost, jak změny v návrhu ve Sněmovně předložit, zkouší to proto prosadit za pomoci některého z poslanců. "Situace se dost dynamicky vyvíjí v závislosti na tom, že vláda posílá do Sněmovny vládní návrh zákona o Šumavě a je otázka, jak to všechno dopadne. Ještě je to dost nejasná věc," uvedl Štekl.